廣東省口腔醫(yī)院建于1962年，2017年1月1日起成建制劃轉(zhuǎn)南方醫(yī)科大學(xué)管理，更名為南方醫(yī)科大學(xué)口腔醫(yī)院（省口腔醫(yī)院、省牙病防治指導(dǎo)中心、廣東省口腔醫(yī)學(xué)研究院），是華南地區(qū)最具規(guī)模的集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防為一體的省級口腔醫(yī)院，也是我國最早建立的五大臨床口腔醫(yī)院之一。   

醫(yī)院現(xiàn)有三個院區(qū)：

總院區(qū)，位于海珠區(qū)江南大道南366號；

番禺院區(qū)，位于番禺區(qū)新藝路12號；

海珠廣場院區(qū)，位于廣州市泰康路178-180號。

目前有教職工997人，其中高級職稱150人，碩士171人，博士及留學(xué)歸國人員70人，博士生導(dǎo)師4人，碩士生導(dǎo)師19人。現(xiàn)有牙科綜合治療臺318張, 年門診量達60余萬人次，住院部及門診年手術(shù)量達８萬余例。醫(yī)院立足華南、影響力輻射港澳臺地區(qū)及海外，被評為“香港市民最信任的內(nèi)地醫(yī)療機構(gòu)。”

醫(yī)院是廣東省口腔醫(yī)療機構(gòu)的龍頭單位，擁有國內(nèi)首屈一指的口腔種植中心，每年接診的種植患者數(shù)量過萬，名列全國之首。牙周病科以全國第二名的成績摘取“國家臨床重點專科”，成為第一批國家臨床重點專科。口腔正畸正頜治療中心、唇腭裂治療中心是國內(nèi)規(guī)模最大、技術(shù)力量最雄厚的專科之一。

在國內(nèi)最早全面開展醫(yī)護1:1“牙科四手操作”服務(wù)，1997年在國內(nèi)率先實現(xiàn)“一人一機一滅菌”，嚴防交叉感染。

廣東省牙病防治指導(dǎo)中心設(shè)在醫(yī)院，承擔起全省口腔疾病防治指導(dǎo)職責。自2009年以來在我省部分地區(qū)實施“窩溝封閉”和“局部涂氟”試點項目。在此試點項目的帶動下，廣州市、深圳市、東莞市政府都投入了大量資金，相繼在全市范圍內(nèi)實施全覆蓋窩溝封閉項目。僅廣州市2011-2016年每年投入600-700萬元，累計封閉49萬多人，為全省齲齒和牙周病的預(yù)防做出重要貢獻，取得良好的社會效益。2015年承擔“第四次全國口腔健康流行病學(xué)調(diào)查”工作，為我省牙病防治工作取得寶貴的資料。

醫(yī)院自1995年起連續(xù)22年舉辦華南國際口腔技術(shù)研討會，成為全國口腔專業(yè)受益面最廣的繼續(xù)醫(yī)學(xué)教育項目。醫(yī)院是廣東省首批40家國家級住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地，是國家醫(yī)師資格考試實踐技能考試基地及考官培訓(xùn)基地。 

醫(yī)院下屬企業(yè)1991年成立的粵誠牙科技術(shù)開發(fā)中心，引進德國先進的牙科工藝生產(chǎn)線和管理模式，成為國內(nèi)第一家大型的社會化義齒加工制作中心。